Seit 2001 wird am Projekt Biosphärenreservat Engiadina Val Müstair gearbeitet.
Der Nationalpark ist dabei als Kernzone vorgesehen. Die Kulturlandschaft der Val Müstair und Teil der Gemeinde Scuol bilden die Pflege- und Entwicklungszone.
2008 wurde das Nationalparkzentrum in Zernez eingeweiht. Dieses Jahrhundertprojekt eröffnet der Öffentlichkeitsarbeit des Nationalparks ganz neue Dimensionen.